- Botryocladia adhaerens
- Botryocladia bahamensis
- Botryocladia beaudettei
- Botryocladia beckeriana
- Botryocladia bermudana
- Botryocladia botryoides
- Botryocladia canariensis
- Botryocladia chiajeana
- Botryocladia exquisita
- Botryocladia flookii
- Botryocladia guaymasensis
- Botryocladia guineensis
- Botryocladia hancockii
- Botryocladia iridescens
- Botryocladia leptopoda
- Botryocladia microphysa
- Botryocladia monoica
- Botryocladia neushulii
- Botryocladia occidentalis
- Botryocladia pseudodichotoma
- Botryocladia pyriformis
- Botryocladia skottsbergi
- Botryocladia uvaria
- Botryocladia wynnei