- Rhaphidorrhynchium amoenum
- Rhaphidorrhynchium andinum
- Rhaphidorrhynchium argyrophyllum
- Rhaphidorrhynchium argyroviride
- Rhaphidorrhynchium aureonitidum
- Rhaphidorrhynchium berberidis
- Rhaphidorrhynchium brachypus
- Rhaphidorrhynchium brevi-horridum
- Rhaphidorrhynchium callidioides
- Rhaphidorrhynchium callidum
- Rhaphidorrhynchium cambouei
- Rhaphidorrhynchium crispans
- Rhaphidorrhynchium dendroligotrichum
- Rhaphidorrhynchium dregei
- Rhaphidorrhynchium flavens
- Rhaphidorrhynchium fragilirostrum
- Rhaphidorrhynchium geheebii
- Rhaphidorrhynchium glaziovii
- Rhaphidorrhynchium gueinzii
- Rhaphidorrhynchium incurvum
- Rhaphidorrhynchium itatiaiae
- Rhaphidorrhynchium leptochaeton
- Rhaphidorrhynchium leptophyllum
- Rhaphidorrhynchium levieri
- Rhaphidorrhynchium lignicola
- Rhaphidorrhynchium lindigii
- Rhaphidorrhynchium macrorhynchum
- Rhaphidorrhynchium meiotocladium
- Rhaphidorrhynchium micans
- Rhaphidorrhynchium olfersii
- Rhaphidorrhynchium percondensatum
- Rhaphidorrhynchium plumularium
- Rhaphidorrhynchium prominulum
- Rhaphidorrhynchium pseudobrachythecium
- Rhaphidorrhynchium purpuripes
- Rhaphidorrhynchium quaylei
- Rhaphidorrhynchium rubricaule
- Rhaphidorrhynchium saprobolax
- Rhaphidorrhynchium schlimii
- Rhaphidorrhynchium subscabrum
- Rhaphidorrhynchium symbolax
- Rhaphidorrhynchium tereticaule
- Rhaphidorrhynchium trichostegum
- Rhaphidorrhynchium viminicola
- Rhaphidorrhynchium zuluense