- Hypholoma australianum
- Hypholoma bermudiense
- Hypholoma brunneum
- Hypholoma californicum
- Hypholoma capnoides
- Hypholoma cutifractum
- Hypholoma dispersum
- Hypholoma elongatum
- Hypholoma epixanthum
- Hypholoma ericaeoides
- Hypholoma ericaeum
- Hypholoma eximium
- Hypholoma fasciculare
- Hypholoma flavovirens
- Hypholoma flocculentum
- Hypholoma fragile
- Hypholoma frowardii
- Hypholoma humidicola
- Hypholoma intonsum
- Hypholoma irroratum
- Hypholoma laeticolor
- Hypholoma lateritium
- Hypholoma marginatum
- Hypholoma myosotis
- Hypholoma olivaceobrunneum
- Hypholoma ornellum
- Hypholoma peckianum
- Hypholoma perplexum
- Hypholoma polytrichi
- Hypholoma popperianum
- Hypholoma radicosum
- Hypholoma subericaeum
- Hypholoma tuberosum
- Hypholoma vinosum