- Hymenoscyphus albidus
- Hymenoscyphus albopunctus
- Hymenoscyphus atrosubiculatus
- Hymenoscyphus bryophilus
- Hymenoscyphus buccinula
- Hymenoscyphus cadiella
- Hymenoscyphus callorioides
- Hymenoscyphus calyculus
- Hymenoscyphus camerunensis
- Hymenoscyphus caracasensis
- Hymenoscyphus caudatus
- Hymenoscyphus cereus
- Hymenoscyphus ciborioides
- Hymenoscyphus clavatus
- Hymenoscyphus consanguineus
- Hymenoscyphus consobrinus
- Hymenoscyphus contortus
- Hymenoscyphus cyathiformis
- Hymenoscyphus epibryus
- Hymenoscyphus erraticus
- Hymenoscyphus eschscholziae
- Hymenoscyphus fastidiosus
- Hymenoscyphus flavofuscescens
- Hymenoscyphus flexipes
- Hymenoscyphus fraternus
- Hymenoscyphus fraxineus
- Hymenoscyphus friesii
- Hymenoscyphus fructigenus
- Hymenoscyphus fuscopurpureus
- Hymenoscyphus gregarius
- Hymenoscyphus herbarum
- Hymenoscyphus humuli
- Hymenoscyphus imberbis
- Hymenoscyphus immutabilis
- Hymenoscyphus improvisus
- Hymenoscyphus infarciens
- Hymenoscyphus javanicus
- Hymenoscyphus lasiopodius
- Hymenoscyphus lepismoides
- Hymenoscyphus leucopsis
- Hymenoscyphus leucopus
- Hymenoscyphus limonium
- Hymenoscyphus lutescens
- Hymenoscyphus menthae
- Hymenoscyphus microserotinus
- Hymenoscyphus miniatus
- Hymenoscyphus montaniensis
- Hymenoscyphus monticola
- Hymenoscyphus musicola
- Hymenoscyphus nigromaculatus
- Hymenoscyphus nitidulus
- Hymenoscyphus pezizoideus
- Hymenoscyphus phiala
- Hymenoscyphus phyllogenus
- Hymenoscyphus phyllophilus
- Hymenoscyphus pileatus
- Hymenoscyphus procerus
- Hymenoscyphus pseudoalbidus
- Hymenoscyphus pseudociliatus
- Hymenoscyphus pusensis
- Hymenoscyphus renisporus
- Hymenoscyphus repandus
- Hymenoscyphus robustior
- Hymenoscyphus rokebyensis
- Hymenoscyphus rozei
- Hymenoscyphus rubroflavus
- Hymenoscyphus rufescens
- Hymenoscyphus rumicis
- Hymenoscyphus saccicola
- Hymenoscyphus salicellus
- Hymenoscyphus sclerogenus
- Hymenoscyphus scutula
- Hymenoscyphus scutuloides
- Hymenoscyphus serotinus
- Hymenoscyphus subferrugineus
- Hymenoscyphus subserotinus
- Hymenoscyphus subtilis
- Hymenoscyphus sulphuratus
- Hymenoscyphus tetracladius
- Hymenoscyphus titubans
- Hymenoscyphus tristis
- Hymenoscyphus tuba
- Hymenoscyphus velhaensis
- Hymenoscyphus vitellinus
- Hymenoscyphus vitigenus
- Hymenoscyphus vitreus