- Stephanostomum aaravi
- Stephanostomum adlardi
- Stephanostomum africanum
- Stephanostomum anisotremi
- Stephanostomum aulostomi
- Stephanostomum australis
- Stephanostomum baccatum
- Stephanostomum belizense
- Stephanostomum beukelaardori
- Stephanostomum bicoronatum
- Stephanostomum caducum
- Stephanostomum californicum
- Stephanostomum carangi
- Stephanostomum casum
- Stephanostomum cesticillum
- Stephanostomum cloacum
- Stephanostomum cobia
- Stephanostomum coryphaenae
- Stephanostomum dentatum
- Stephanostomum ditrematis
- Stephanostomum euzeti
- Stephanostomum fijiensis
- Stephanostomum fistulariae
- Stephanostomum gaidropsari
- Stephanostomum ghanensis
- Stephanostomum hawaiiense
- Stephanostomum hispidum
- Stephanostomum interruptum
- Stephanostomum japonocasum
- Stephanostomum kawalea
- Stephanostomum kovalevae
- Stephanostomum lamothei
- Stephanostomum lineatum
- Stephanostomum madhaviae
- Stephanostomum megacephalum
- Stephanostomum microsomum
- Stephanostomum microstephanum
- Stephanostomum minutum
- Stephanostomum multispinosum
- Stephanostomum naucrotis
- Stephanostomum noumeaense
- Stephanostomum nunu
- Stephanostomum nyoomwa
- Stephanostomum pacificum
- Stephanostomum pagrosomi
- Stephanostomum paratantabiddii
- Stephanostomum petimba
- Stephanostomum platacis
- Stephanostomum polymixiae
- Stephanostomum polynemi
- Stephanostomum pristis
- Stephanostomum promicropsi
- Stephanostomum provitellosum
- Stephanostomum pseudocarangis
- Stephanostomum pseudoditrematis
- Stephanostomum qatarense
- Stephanostomum robustum
- Stephanostomum sentum
- Stephanostomum seriolae
- Stephanostomum sierraleonensis
- Stephanostomum solontschenkae
- Stephanostomum tantabiddii
- Stephanostomum tenue
- Stephanostomum triacanthi
- Stephanostomum triglae
- Stephanostomum tristephanum
- Stephanostomum tupatupa
- Stephanostomum uku
- Stephanostomum valdeinflatum
- Stephanostomum votonimoli
- Stephanostomum yagara