- Ancistrus bodenhameri
- Ancistrus brevifilis
- Ancistrus brevipinnis
- Ancistrus bufonius
- Ancistrus caucanus
- Ancistrus centrolepis
- Ancistrus chagresi
- Ancistrus cirrhosus
- Ancistrus clementinae
- Ancistrus cryptophthalmus
- Ancistrus damasceni
- Ancistrus dolichopterus
- Ancistrus eustictus
- Ancistrus falconensis
- Ancistrus formoso
- Ancistrus galani
- Ancistrus greeni
- Ancistrus gymnorhynchus
- Ancistrus heterorhynchus
- Ancistrus hoplogenys
- Ancistrus latifrons
- Ancistrus leucostictus
- Ancistrus lithurgicus
- Ancistrus macrophthalmus
- Ancistrus malacops
- Ancistrus marcapatae
- Ancistrus martini
- Ancistrus megalostomus
- Ancistrus montanus
- Ancistrus nudiceps
- Ancistrus occidentalis
- Ancistrus occloi
- Ancistrus pirareta
- Ancistrus piriformis
- Ancistrus ranunculus
- Ancistrus spinosus
- Ancistrus stigmaticus
- Ancistrus tamboensis
- Ancistrus taunayi
- Ancistrus temminckii
- Ancistrus tolima
- Ancistrus triradiatus
- Ancistrus variolus