- Apogon americanus
- Apogon argyrogaster
- Apogon atradorsatus
- Apogon atricaudus
- Apogon aurolineatus
- Apogon axillaris
- Apogon balinensis
- Apogon beanforti
- Apogon binotatus
- Apogon campbelli
- Apogon caudicinctus
- Apogon cladophilus
- Apogon coccineus
- Apogon crassiceps
- Apogon dammermani
- Apogon deetsie
- Apogon dhofar
- Apogon dianthus
- Apogon doryssa
- Apogon dovii
- Apogon erythrinus
- Apogon erythrosoma
- Apogon gouldi
- Apogon guadalupensis
- Apogon hypselonotus
- Apogon imberbis
- Apogon indicus
- Apogon kautamea
- Apogon kuatamea
- Apogon lachneri
- Apogon lativittatus
- Apogon leptocaulus
- Apogon lineatus
- Apogon lineomaculus
- Apogon maculatus
- Apogon marquesensis
- Apogon microspilus
- Apogon mosavi
- Apogon nitidus
- Apogon pacificus
- Apogon phenax
- Apogon pillionatus
- Apogon planifrons
- Apogon posterofasciatus
- Apogon pseudomaculatus
- Apogon quadrisquamatus
- Apogon retrosella
- Apogon robbyi
- Apogon robinsi
- Apogon rubellus
- Apogon rubrifuscus
- Apogon seminigracaudus
- Apogon semiornatus
- Apogon susanae
- Apogon talboti
- Apogon townsendi
- Apogon tricinctus
- Apogon unicolor
- Apogon wickmanni