- Graptomyza antipoda
- Graptomyza atripes
- Graptomyza aurea
- Graptomyza bergi
- Graptomyza brevirostris
- Graptomyza chaetomelas
- Graptomyza coniceps
- Graptomyza cornuta
- Graptomyza elegans
- Graptomyza flavipes
- Graptomyza flavitincta
- Graptomyza gibbula
- Graptomyza globigaster
- Graptomyza hardyi
- Graptomyza inclusa
- Graptomyza interrupta
- Graptomyza jacobsoni
- Graptomyza javensis
- Graptomyza lineata
- Graptomyza longirostris
- Graptomyza microdon
- Graptomyza mitis
- Graptomyza nigricavum
- Graptomyza nigripes
- Graptomyza oceanica
- Graptomyza palmeri
- Graptomyza perforata
- Graptomyza punctata
- Graptomyza rectifacies
- Graptomyza robusticornis
- Graptomyza seimunda
- Graptomyza signata
- Graptomyza triangulifera
- Graptomyza trilineata
- Graptomyza triseriata
- Graptomyza uchiyamai
- Graptomyza ventralis