- Pegomya abnormis
- Pegomya affinis
- Pegomya aldrichi
- Pegomya atlanis
- Pegomya atriplicis
- Pegomya basiseta
- Pegomya betae
- Pegomya bicolor
- Pegomya caduca
- Pegomya caesia
- Pegomya calyptrata
- Pegomya carduorum
- Pegomya circumpolaris
- Pegomya cognata
- Pegomya conformis
- Pegomya cunicularia
- Pegomya depressiventris
- Pegomya dulcamarae
- Pegomya duplicoides
- Pegomya exilis
- Pegomya flavifrons
- Pegomya fulgens
- Pegomya fumipennis
- Pegomya fuscinata
- Pegomya haemorrhoum
- Pegomya hernandezi
- Pegomya holosteae
- Pegomya hyoscyami
- Pegomya incisiva
- Pegomya interruptella
- Pegomya kodiakana
- Pegomya laticornis
- Pegomya magdalenensis
- Pegomya meridiana
- Pegomya moehringiae
- Pegomya neomexicana
- Pegomya nigrisquama
- Pegomya notabilis
- Pegomya pseudobicolor
- Pegomya quadralils
- Pegomya rubivora
- Pegomya rufescens
- Pegomya ruficeps
- Pegomya rufina
- Pegomya rutila
- Pegomya scapularis
- Pegomya seitenstettensis
- Pegomya setaria
- Pegomya setibasis
- Pegomya silvicola
- Pegomya simplex
- Pegomya sociella
- Pegomya solennis
- Pegomya steini
- Pegomya suaedae
- Pegomya tabida
- Pegomya terebrans
- Pegomya testacea
- Pegomya transgressa
- Pegomya unicolor
- Pegomya utahensis
- Pegomya variegata
- Pegomya versicolor
- Pegomya verticala
- Pegomya vittigera
- Pegomya winthemi
- Pegomya wygodzinskyi
- Pegomya zonata