- Calycomyza allecta
- Calycomyza ambrosiae
- Calycomyza artemisiae
- Calycomyza bicolor
- Calycomyza crotalarivora
- Calycomyza cynoglossi
- Calycomyza dominicensis
- Calycomyza enceliae
- Calycomyza eupatorivora
- Calycomyza flavinotum
- Calycomyza frickiana
- Calycomyza gigantea
- Calycomyza humeralis
- Calycomyza hyptidis
- Calycomyza ipomaeae
- Calycomyza jucunda
- Calycomyza lantanae
- Calycomyza majuscula
- Calycomyza malvae
- Calycomyza melantherae
- Calycomyza menthae
- Calycomyza meridiana
- Calycomyza michiganensis
- Calycomyza novascotiensis
- Calycomyza platyptera
- Calycomyza promissa
- Calycomyza solidaginis
- Calycomyza stegmaieri
- Calycomyza verbenae
- Calycomyza verbesinae